Magisterský studijní program "Geodézie a kartografie" navazuje na bakalářský studijní program "Geodézie a kartografie" tak, že jeho absolvent je vybaven širšími teoretickými znalostmi z oblasti nejnovějších vědecko-technických poznatků oboru.
Studium magisterského studijního programu se ukončuje státní závěrečnou zkouškou, která se skládá ze zkoušek z odborných předmětů a obhajoby diplomové práce, kterou student prokazuje schopnost řešit komplexní problémy oboru v oblasti technické či teoretické.